奇美醫院歷經多年的變革，其進步有目共睹。
本院胸腔外科在民國79年邀請到吳明和教授至本院做一星期一次的特別門診，並執行胸腔外科的相關手術，開始了本院胸腔外科的服務。
於民國82年，有鑑於兼職醫師無法全盤兼顧本院日益成長之胸腔外科手術需求，本院派任馮瑤醫師前往台北榮民總醫院接受胸腔外科專科之完整訓練。馮瑤醫師歷經二年半的訓練之後，於民國84年9月返回本院，正式成立本院之胸腔外科，並擔任主任，肩負起照顧本院胸腔外科病患與臨床訓練的重責大任。
目前奇美醫療體系，連同柳營奇美醫院，共有五位胸腔外科專科醫師，分別是馮瑤主任、蘇英傑醫師、陳照坤醫師、盧建志醫師與梁瑞麟醫師，協力提供雲嘉南地區胸腔外科病患之最佳照顧與治療。
