胸腔外科是一外科之次專科，臨床服務的範圍涵蓋頸部、胸部及腹部；其間的臟器，除心臟及主動脈等循環臟器外，皆為本科之診斷及治療之範圍。
若以器官區分，可分為以下適應症：
- 肺臟疾病：肺臟惡性腫瘤、肺臟良性腫瘤、呼吸道內異物、肺結核、支氣管擴張症、游離肺、氣切、氣管狹窄…等。
- 肋膜腔疾病：氣胸、血胸、膿胸、肝性胸水、肋膜積水…等。
- 縱膈腔疾病：縱膈腔惡性腫瘤、縱膈腔良性腫瘤、胸腺瘤、胸腔內甲狀腺、肌無力症、深頸部感染、縱膈腔炎…等。
- 胸壁疾病：胸部外傷、肋骨骨折、胸壁腫瘤、漏斗胸、雞胸、橫膈疾病…等。
- 食道疾病：食道惡性腫瘤、食道良性腫瘤、胃食道逆流、食道內異物、上消化道腐蝕性傷害、食道狹窄、橫膈疝氣、灌食管路、胃鏡…等。