隨著醫學發展, 微創手術亦成為本科之主要發展方向。
本科於民國95年，率先在南部地區引進微創型漏斗胸整形術之技術 (Nuss procedure)，避免了傳統型漏斗胸整形術之大範圍創傷，利用內視鏡之技術完成胸骨整形，可大幅減少手術後恢復時間及疼痛。
本科亦長期投入微創手術治療，從民國97年開始，早期肺癌病人皆常規接受胸腔鏡肺葉切除手術，可切除的食道癌病人也廣泛性的接受胸腔鏡食道切除手術，大幅增進美觀及改善術後疼痛。
隨著醫療技術的進步，本院於民國101年於南台灣率先引進達文西（da Vinci Si）機械手臂手術系統，讓南部鄉親也能接受與世界潮流同步的醫療服務。透過其完美影像、及穩定精細的機械手臂操作，讓複雜內視鏡手術成為可能。本科亦於2012年同步開始進行達文西肺癌手術、食道癌手術及縱膈腔腫瘤手術，為台灣胸腔外科達文西手術之先驅，至今仍是台灣達文西食道癌手術經驗最豐之團隊。
對於癌症的治療，絕非單一科別、單一種類治療所能勝任。本院之肺癌及食道癌病人，皆由奇美醫院癌症中心統籌組織肺癌委員會及食道癌委員會，本科亦深度參與委員會之運作，除了制定及調整癌症之治療方針，團隊也常規針對癌症病例進行討論，在治療方式上取得共識並據以調整，以確認治療方向正確，維護病人權益。
本科除了注重病患之臨床服務外，本科亦於病人安全、醫學教育與醫療研發方面投注許多心力。除了不斷參與病人安全改善計畫，本科亦協助醫院建立微創手術訓練課程，而蘇英傑醫師也與產業界合作研發，目前擔任上銀科技的研發顧問，期許對台灣的醫療研發有所貢獻。
