社會服務部主要業務為三部分，社工組為運用社會工作知識與技術，評估與處理就醫民眾及其家屬於醫療過程中衍生之身、心、靈、社等問題，並結合社會福利資源，連同社政、衛政、警政等跨單位合作，協助其排除障礙，增強社會適應能力。服務組為處理本院公共事務對外有關單位之協調與聯繫事項、傳播媒體之採訪及聯繫事項、公部門暨民意機構相關業務聯繫等事務，與在地民眾建立友善互動關係，增進對本院之認識及信賴。醫病關係為本院申訴管道及調處機制的窗口，處理民眾及家屬就醫期間所表達之意見，以促進醫病溝通及和諧的醫病關係。
社會服務部本著奇美醫療體系『關懷、專業、效率』的核心價值，扮演好醫病之間的溝通橋樑，並以全方位的醫療服務，來照顧南部地區民眾的健康，達成民眾最信賴的健康照護體系之目標。